พระปฐมเจดีย์ นครไชยศรี
เมื่อครั้งพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวรัชกาลที่ ๔ ทรงผนวชอยู่นั้นได้เสด็จไปนมัสการพระปฐมเจดีย์ ซึ่งเป็นพระเจดีย์โบราณ เห็นสมควรว่าควรจะบูรณะปฏิสังขรณ์ใหม่ให้อยู่ในสภาพดี เป็นโบราณสถานที่สำคัญในพระพุทธศาสนา เมื่อเสด็จขึ้นเถลิงถวัลย์ราชสมบัติแล้ว จึงโปรดให้สมเด็จเจ้าพระยาบรมมหาประยุรวงศ์ (ดิศ บุนนาค) เป็นแม่กอง ต่อมาท่านถึงพิราลัย โปรดให้เจ้า พระยาทิพากรวงศ์ (ขำ บุนนาค) เป็นแม่กอง ทำการปฏิสังขรณ์พระปฐมเจดีย์มาจนตลอดรัชกาล

คลองมหาสวัสดิ์
อยู่ในตำบลมหาสวัสดิ์ อำเภอบางกรวย จังหวัดนนทบุรี และเขตอำเภอนครชัยศรี จังหวัดนครปฐม พระบาทสมเด็จพระจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว โปรดเกล้าฯ ให้เจ้าพระยาทิพากรวงศ์ (ขำ บุนนาค) และพระภาษีสมบัติบริบูรณ์ เป็นแม่กองจ้างชาวจีนขุด เมื่อ พ.ศ. ๒๔๐๒ เสร็จ พ.ศ. ๒๔๐๓ ระยะทางเริ่มตั้งแต่คลองบางกรวยที่บริเวณใกล้วัดชัยพฤกษมาลา ไปบรรจบแม่น้ำนครชัยศรี ริมศาลเจ้าสุบิน ตำบลงิ้วลาย อำเภอนครชัยศรี จังหวัดนครปฐม

คลองมหาสวัสดิ์ยาวประมาณ ๒๘ กิโลเมตร ไหลผ่านตำบลท่าเรือ ตำบลงิ้วลาย ตำบลมหาสวัสดิ์ และตำบลศาลายา ในอำเภอนครชัยศรี จังหวัดนครปฐม ตำบลปลายบาง ตำบลศาลากลาง ตำบลบางคูเวียง ตำบลบางขุนกอง และตำบลมหาสวัสดิ์ในอำเภอบางกรวย จังหวัดนนทบุรี

คลองดำเนินสะดวก
พ.ศ. ๒๔๐๙ รัชกาลที่ ๔ โปรดเกล้าฯ ให้เจ้า พระยาศรีสุริยวงศ์ที่สมุหพระกลาโหม เป็นแม่กองขุดคลอง จากแม่น้ำเมืองนครชัยศรี ที่ตำบลบางยาง ไปบรรจบคลองบางนกแขวก อันเป็นคลองของแม่น้ำแม่กลองระยะทาง ๘๔๐ เส้น เสร็จใน พ.ศ. ๒๔๑๑

ก่อนจะมีคลองดำเนินสะดวก ชาวเรือจะเดินทางจากแม่น้ำท่าจีน (นครชัยศรี) ไปยังแม่น้ำแม่กลอง อาศัยคลองสุนัขหอน ซึ่งคดเคี้ยวมาก และตื้นเขินในบางตอน เมื่อขุดคลองตัดตรง คนทั้งหลายจึงใช้คลองดำเนินสะดวกแทน

นอกจากนี้เจ้าพระยาศรีสุริยวงศ์ยังได้ออกเงินส่วนตัวขุดคลองบางลี่ จากแม่น้ำแม่กลองไปบรรจบคลองยี่สาร ซึ่งเป็นคลองสายหนึ่งของแม่น้ำเพชรบุรีอีกด้วย

คลองแสนแสบ
ในสมัยรัชกาลที่ ๓ โปรดเกล้าฯ ให้พระยาศรีพิพัฒรัตนราชโกษาธิบดี (ทัต บุนนาค) เป็นแม่กองจ้างคนจีนขุดคลอง ตั้งแต่หัวหมากไปถึงบางขนาก เมื่อ พ.ศ. ๒๓๘๐ และขุดเสร็จในปี พ.ศ. ๒๓๘๓ เป็นคลองยาว ๑,๓๓๗ เส้น คลองนี้เรียกชื่อแบ่งเป็น ๒ ตอน คือคลองแสนแสบ และคลองบางขนาก

พ.ศ. ๒๔๑๙ พระบาทสมเด็จพระจุลจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว ทรงพระราชดำริว่าคลองที่ใช้เป็นเส้นทางไปมา ระหว่างทางกรุงเทพฯ กับฉะเชิงเทรานั้นยังอ้อมไกลอยู่ ถ้าขุดคลองลัดตัดทางให้สั้นเข้าจะได้ประโยชน์มีหลายประการ จึงมีพระบรมราชโองการให้สมเด็จเจ้าพระยาบรมมหาศรีสุริยวงศ์ (ช่วง บุนนาค) แต่งตั้งเจ้าพนักงานขุดคลอง ตั้งแต่ศาลากลาง คลองแสนแสบ ตรง ไปบรรจบปลายคลองท่าไข่ แขวงเมืองฉะเชิงเทรา

สมเด็จเจ้าพระยาบรมมหาศรีสุริยวงศ์ ตั้งให้พระยาชลธารวินิจฉัย เป็นแม่กอง ลงมือขุดเมื่อ พ.ศ. ๒๔๑๙ ใช้เวลา ๒๑ เดือน แล้วเสร็จใน พ.ศ. ๒๔๒๐ ทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ ให้พระยาวิเศษฤาไชย ผู้ว่าราชการจังหวัดฉะเชิงเทรา จัดการเป็นพระราชพิธีเปิดคลอง ในวันที่ ๒๐ มีนาคม พ.ศ. ๒๔๒๐ พระราชทานนามว่า "คลองนครเนื่องเขตร"